决定智力形成和发展的因素，当然也是决定男女两性智力差异的因素。生物学家认为、男女两性智力差异首先是具有生物前提的。有关智力方面的男女两性遗传因素的差别，大致有如下两种说法。
1．染色体说
有关研究表明，染色体数目的变化或结构的改变，会引起各种染色体病而影响智力发展。染色体畸变相对容易在男性身上发生，从而导致男性智力缺陷和智力低下的人数多于女性。而且，同是某种染色体畸变，对男女两性智力的影响也是不同的。例如，男性如果多一条X染色体，就不能生育，并使其智力明显低下。而女性若多一条X染色体，一般不会影响生育，对智力影响也不像男性那样严重。
2．性激素说
性腺激素(即荷尔蒙)会引起心理与智力的变化。美国生物学家莫内和埃尔哈特在1972年曾对一组4～16岁的女孩做过试验，即给她们注入雄性激素，结果显示这组女孩比另一组其他条件相似的女孩子表现出较多的“假小子”特征，从而证明激素影响个体的心理与行为。由于荷尔蒙的作用，男女两性的大脑功能在成熟化、特长化、优势化等方面表现出差异。一般说来，脑的左半球具有处理抽象的语言信息的功能，右半球则具有处理形象的非语言信息的功能优势。女性的大脑比男性的大脑成熟早一些，而且左半球又比右半球成熟得早，所以左半球优势化就早一些。因此，女性就较早地表现出比较强的语言信息处理能力。女性连结大脑左右半球的组织具有较强的神经传导机制，所以女性大脑活动具有双联的特征。男性大脑的右半球比左半球成熟得早，所以右半球特长化和优势化比左半球明显，并比女性强。因此，男性表现出对非语言信息处理有较强的能力。男性的大脑活动不像女性具有双联活动的特征，而表现出“一侧优势”，即右侧优势。所以，生物学家们认为，生物学的遗传因素对造成智力发展性别差异的作用是客观存在的。